Scott Thomas có lẽ nổi tiếng nhất về vai diễn chính như người vợ không chung thủy trong phim The English Patient, một trong các phim thành công nhất năm 1996. Trong thập kỷ 1990, bà đóng cặp với Hugh Grant trong phim Bitter Moon và phim thành công về bán vé trên toàn cầu Four Weddings and a Funeral (Bốn đám cưới và một đám tang).

Năm 2001 Kristin đóng vai Lady Sylvia McCordle trong phim đoạt giải Oscar Gosford Park.

Bà cũng xuất hiện trong phim truyền hình Book Clubbin' năm 2003, tập Absolutely Fabulous (bà đóng vai nhân vật Plum Berkeley).

Bà được thưởng Huân chương Đế chế Anh năm 2003, và cũng được chính phủ Pháp thưởng Bắc Đẩu bội tinh ngày 01.01.2005.

Đầu năm 2007, bà đóng vai Arkadina trong The Seagull của Anton Chekhov, sản xuất ở London và đoạt giải Laurence Olivier cho nữ diễn viên xuất sắc nhất ngày 9.3.2008.[10] Bà đã diễn lại vai này ở New York trong tháng 9 năm 2008.[11]

Năm 2006, bà đóng vai Hélène trong phim nói tiếng Pháp Ne le dis à personne (Tell No One), do Guillaume Canet đạo diễn. Năm 2008, Scott Thomas được khen ngợi nhiều về diễn xuất trong một phim Pháp khác, Il y a longtemps que je t'aime (I've Loved You So Long), trong đó bà được đề cử cho vai nữ chính xuất sắc nhất của cả giải BAFTA và Giải Quả cầu vàng.

Năm 2008, Scott Thomas đóng vai Elizabeth Boleyn, Countess of Wiltshire mẹ của Mary, Anne và George trong phim The Other Boleyn Girl.

Năm 2009, bà đóng vai người sáng lập và chủ bút một tạp chí thời trang trong phim Confessions of a Shopaholic.

Bà đóng vai chính trong phim mà kịch bản được chuyển thể từ tiểu thuyết "The Woman in the Fifth" của Douglas Kennedy, theo kế hoạch sẽ được phát hành vào cuối năm 2010.[12]

Năm 2011, Scott Thomas sẽ đóng vai chính trong phim Bel Ami sắp tới như là một người yêu khác của George Duroy (do Robert Pattinson diễn xuất).[13]